Physics protein 1

A.Y. 2015/2016
6
Max ECTS
48
Overall hours
SSD
FIS/03
Language
Italian
Learning objectives
Il corso introduce alcuni aspetti del ripiegamento delle proteine ed approfondisce gli aspetti di meccanica statistica di questi sistemi. Oltre a fornire le basi per capire il comportamento delle proteine in soluzione, il corso rappresenta un'esempio di applicazione di numerose tecniche di meccanica statistica di equilibrio e di nonequilibrio, e quindi può essere di interesse a tutti gli studenti che vogliano studiare sistemi complessi.
Expected learning outcomes
Undefined
Course syllabus and organization

Single session

Responsible
Lesson period
First semester
Course syllabus
Introduction on proteins; rehearsal of statistical mechanics.
Interactions among amino acids, statistic derivation of van der Waals parameters; hydrophobic interaction.
Polymer theory; ideal chain, random coil and globules; coil-globule transition, helix-coil transition.
Disordered interactions: the random energy model; drops of replica method; energetic properties of proteins.
Molecular dynamics; Langevin equationl probabilistic theory; Fokker-Planck equation; barrier jump; Kramers equation.
Stochastic processes; thermodynamic sampling; Monte Carlo methods and its variants.
Semplified models of proteins and numerical techniques.
Protein sequence space and molecular evoultion.
FIS/03 - PHYSICS OF MATTER - University credits: 6
Lessons: 48 hours
Professor: Tiana Guido
Professor(s)
Reception:
Friday, h. 11-13