Imaging techniques in bio-medical research

A.A. 2018/2019
Insegnamento per
8
Crediti massimi
48
Ore totali
SSD
BIO/10 VET/01
Lingua
Inglese
Obiettivi formativi
L'analisi per immagini rappresenta un campo emergente delle scienze biomediche e ciò è dimostrato dal numero crescente di corsi disponibili presso prestigiose università nel mondo, dall'offerta di opportunità di impiego e dal sempre maggior ricorrere di queste tecnologie nelle pubblicazioni scientifiche del settore biotecnologico e biomedico. Con la frequenza del corso, lo studente impara che è possibile estendere il suo orizzonte di approccio biotecnologico mediante la raccolta di dati biologici di primaria importanza, ottenuti e rielaborati mediante l'applicazione di principi fisici e matematici di elevata precisione e riproducibilità. I dati sono poi rielaborati e processati per poter essere interpretati opportunamente.

Struttura insegnamento e programma

Edizione attiva
Responsabile
Moduli o unità didattiche
Module: Image analysis of cells and tissue
VET/01 - ANATOMIA DEGLI ANIMALI DOMESTICI - CFU: 4
Lezioni: 24 ore
Docente: Brevini Tiziana

Module: MALDI imaging
BIO/10 - BIOCHIMICA - CFU: 2
Lezioni: 12 ore

Module: Molecular Imaging
VET/01 - ANATOMIA DEGLI ANIMALI DOMESTICI - CFU: 2
Lezioni: 12 ore
Docente: Brevini Tiziana

STUDENTI FREQUENTANTI
Prerequisiti e modalità di esame
L'esame consiste in una parte orale (50% del voto finale) e un test pratico (50% del voto finale).
Metodi didattici
lezioni frontali, esercitazioni e seminari
Module: Image analysis of cells and tissue
Programma
Basic concepts in imaging. Electromagnetic radiation and interactions with Matter (2 hours),
Optics, including lenses and reflection. Generators, filters and detectors (1 hour)
Biological effects of radiation. Safety considerations (1 hour).
Imaging systems for biological molecole (Proteins, lipids, nucleic acids) (2 hours)
Trasmission microscopy (1 hour)
Scanning microscopy (1 hour)
Phase contrast microscopy (1 hour)
Fluorescence microscopy (1 hour)
Confocal and multiphoton microscopy (2 hours)
Imaging of live and fixed cells (2 hours)
Fluorescence Resonance Energy Transfer (2 hours)
Use of radioisotopes for imaging con radionuclide (1 hour)
Magnetic resonance (1 hour)

Practical training total hours

Time-lapse of living systems 2
Use of algorithms used in imaging 1
Processing, digitalization deconvolution 1
Image degradation, Spatial resolution, Signal and noise 1
Image measurements, histograms 1
Use of Image 1.62 NIH program 2
Use of Leica Confocal System 2
Use of Nikon NKM Program 2
Metodi didattici
The exam consists of 1 final oral test (50% final mark) and 1 practical test (50% final mark)
Materiale didattico e bibliografia
Handouts will be available to students
Module: MALDI imaging
Programma
ORGANIZZAZIONE DEL MODULO:

Lezioni ore totali
Preparazione del campione 4
Spettrometria di massa e imaging 4
Identificazione di proteine ed analisi 4
Metodi didattici
L'esame consiste in una parte orale (50% del voto finale) e un test pratico (50% del voto finale).
Materiale didattico e bibliografia
Riferimenti bibliografici e siti Internet saranno forniti durante le lezioni
Module: Molecular Imaging
Programma
Preliminary overview 4
Relaxation Theory and Mechanisms
Magnetic properties and image effects
Extracellular fluid agents 2
Organ-specific agents 2
Ultrasound theory and demonstration
Scintigraphy and Tomography scanning 2
Bioluminescent imaging and the use of reporter in vivo 2
Metodi didattici
The exam consists of 1 final oral test (50% final mark) and 1 practical test (50% final mark)
Materiale didattico e bibliografia
References and Internet links will be available
STUDENTI NON FREQUENTANTI
Prerequisiti e modalità di esame
L'esame consiste in una parte orale (50% del voto finale) e un test pratico (50% del voto finale).
Module: Image analysis of cells and tissue
Programma
Basic concepts in imaging. Electromagnetic radiation and interactions with Matter (2 hours),
Optics, including lenses and reflection. Generators, filters and detectors (1 hour)
Biological effects of radiation. Safety considerations (1 hour).
Imaging systems for biological molecole (Proteins, lipids, nucleic acids) (2 hours)
Trasmission microscopy (1 hour)
Scanning microscopy (1 hour)
Phase contrast microscopy (1 hour)
Fluorescence microscopy (1 hour)
Confocal and multiphoton microscopy (2 hours)
Imaging of live and fixed cells (2 hours)
Fluorescence Resonance Energy Transfer (2 hours)
Use of radioisotopes for imaging con radionuclide (1 hour)
Magnetic resonance (1 hour)

Practical training total hours

Time-lapse of living systems 2
Use of algorithms used in imaging 1
Processing, digitalization deconvolution 1
Image degradation, Spatial resolution, Signal and noise 1
Image measurements, histograms 1
Use of Image 1.62 NIH program 2
Use of Leica Confocal System 2
Use of Nikon NKM Program 2
Materiale didattico e bibliografia
Handouts will be available to students
Module: MALDI imaging
Programma
ORGANIZZAZIONE DEL MODULO:

Lezioni ore totali
Preparazione del campione 4
Spettrometria di massa e imaging 4
Identificazione di proteine ed analisi 4
Materiale didattico e bibliografia
Riferimenti bibliografici e siti Internet saranno forniti durante le lezioni
Module: Molecular Imaging
Programma
Preliminary overview 4
Relaxation Theory and Mechanisms
Magnetic properties and image effects
Extracellular fluid agents 2
Organ-specific agents 2
Ultrasound theory and demonstration
Scintigraphy and Tomography scanning 2
Bioluminescent imaging and the use of reporter in vivo 2
Materiale didattico e bibliografia
References and Internet links will be available
Periodo
Secondo semestre
Periodo
Secondo semestre
Modalità di valutazione
Esame
Giudizio di valutazione
voto verbalizzato in trentesimi
Docente/i
Ricevimento:
tutti i giorni previo appuntamento
Ricevimento:
Lunedi dalle 10:30 alle12:30