Metodi biochimici e biologico molecolari applicati alle biotecnologie
A.A. 2024/2025
Obiettivi formativi
Il corso si propone l'acquisizione da parte degli studenti di conoscenze circa i principali metodi e tecnologie associate alla biologia molecolare e biochimica nel contesto della ricerca biotecnologica e in applicazioni diagnostiche e terapeutiche. Il corso comprende anche una parte di esercitazioni pratiche su tematiche inerenti.
Risultati apprendimento attesi
Alla fine del corso lo studente avrà acquisito tutte le conoscenze teoriche e pratiche su metodi di biologia molecolare e biochimica per cominciare a lavorare in modo efficace in un laboratorio in cui si usano tecniche attinenti.
Periodo: annuale
Modalità di valutazione: Esame
Giudizio di valutazione: voto verbalizzato in trentesimi
Corso singolo
Questo insegnamento può essere seguito come corso singolo.
Programma e organizzazione didattica
Edizione unica
Responsabile
Periodo
annuale
Prerequisiti
Sono richieste buone conoscenze di biochimica e biologia molecolare. Propedeuticità consigliate: Chimica biologica e Biologia Molecolare
Modalità di verifica dell’apprendimento e criteri di valutazione
Modalità di esame. Scritto (domande aperte): si valuta la correttezza e la completezza delle risposte. La logica utilizzata nell'interpretazione di esperimenti.
Modulo: Metodi biochimici
Programma
- Tecniche di base di analisi e purificazione di proteine (Omogenizzazione, centrifugazione, cromatografie, elettroforesi)
- Metodi spettroscopici (spettroscopia di assorbimento, fluorescenza e dicroismo circolare), valutazione dell'attività biologica (dosaggi di attività biologica, dosaggi di attività enzimatica).
- Tecniche di Biologia Strutturale
- Tecniche di analisi dell'interazione proteina-proteina o proteina-ligando.
- Anticorpi: struttura e funzione. Anticorpi policlonali e monoclonali. ELISA, Western Blot e Phage display. Uso di anticorpi in diagnosi e terapia, anticorpi umanizzati. Vaccini ricombinanti.
- Tecniche di ingegnerizzazione di proteine: Mutagenesi sito diretta, Mutagenesi casuale (directed evolution, molecular breeding: error prone PCR, DNA shuffling, ITCHY). Metodi di screening di varianti proteiche ottenute mediante mutagenesi.
- Enzimi: Dosaggi enzimatici, uso di enzimi per il dosaggio di metaboliti.
- Classi di proteine di interesse industriale e in terapia: Proteine del sangue (fattori di coagulazione, lisi del coagulo), Proteasi, lipasi, amilasi, Enzimi termostabili, Enzimi immobilizzati, biosensori.
- Il corso prevede la discussione a lezione di numerosi esempi di ricerca pubblicata su riviste scientifiche.
-Il corso prevede 16 ore di esercitazioni di laboratorio a posto singolo sulle tematiche affrontate durante il corso
- Metodi spettroscopici (spettroscopia di assorbimento, fluorescenza e dicroismo circolare), valutazione dell'attività biologica (dosaggi di attività biologica, dosaggi di attività enzimatica).
- Tecniche di Biologia Strutturale
- Tecniche di analisi dell'interazione proteina-proteina o proteina-ligando.
- Anticorpi: struttura e funzione. Anticorpi policlonali e monoclonali. ELISA, Western Blot e Phage display. Uso di anticorpi in diagnosi e terapia, anticorpi umanizzati. Vaccini ricombinanti.
- Tecniche di ingegnerizzazione di proteine: Mutagenesi sito diretta, Mutagenesi casuale (directed evolution, molecular breeding: error prone PCR, DNA shuffling, ITCHY). Metodi di screening di varianti proteiche ottenute mediante mutagenesi.
- Enzimi: Dosaggi enzimatici, uso di enzimi per il dosaggio di metaboliti.
- Classi di proteine di interesse industriale e in terapia: Proteine del sangue (fattori di coagulazione, lisi del coagulo), Proteasi, lipasi, amilasi, Enzimi termostabili, Enzimi immobilizzati, biosensori.
- Il corso prevede la discussione a lezione di numerosi esempi di ricerca pubblicata su riviste scientifiche.
-Il corso prevede 16 ore di esercitazioni di laboratorio a posto singolo sulle tematiche affrontate durante il corso
Metodi didattici
Lezioni frontali ed esercitazioni di laboratorio a posto singolo
Materiale di riferimento
Un testo di metodi biochimici tra cui possono essere segnalati:
- K.Wilson & J.M.Walker Principles and techniques of Biochemistry and Molecular Biology, Cambridge University Press
- M. Stoppini & V. Bellotti Biochimica Applicata EdiSES
Le tecniche piu moderne discusse a lezione non sono illustrate su libri di testo e devono essere studiate su appunti.
- K.Wilson & J.M.Walker Principles and techniques of Biochemistry and Molecular Biology, Cambridge University Press
- M. Stoppini & V. Bellotti Biochimica Applicata EdiSES
Le tecniche piu moderne discusse a lezione non sono illustrate su libri di testo e devono essere studiate su appunti.
Modulo: Metodi biologico molecolari
Programma
- Tecniche di base (DNA/RNA elettroforesi e varianti, Southern/Northern blot, PCR, clonaggi )
- Costruzione di librerie genomiche e cDNA, vettori di clonaggio, applicazione
- Screening genetici, phage display, two hybrid e varianti
- Tecniche di sequenziamento del DNA, NGS di prima e seconda generazione
- Utilizzo di organismi modello
- Screening per letalità sintetica e applicazione come strategia terapeutica
- Genome editing e Generazione di mutanti
- Studio dell'espressione genica
- Interazioni proteine-acidi nucleici
- Il corso prevede la discussione a lezione di esempi di ricerca pubblicata su riviste scientifiche.
-Il corso prevede 16 ore di esercitazioni di laboratorio a posto singolo sulle tematiche affrontate durante il corso
- Costruzione di librerie genomiche e cDNA, vettori di clonaggio, applicazione
- Screening genetici, phage display, two hybrid e varianti
- Tecniche di sequenziamento del DNA, NGS di prima e seconda generazione
- Utilizzo di organismi modello
- Screening per letalità sintetica e applicazione come strategia terapeutica
- Genome editing e Generazione di mutanti
- Studio dell'espressione genica
- Interazioni proteine-acidi nucleici
- Il corso prevede la discussione a lezione di esempi di ricerca pubblicata su riviste scientifiche.
-Il corso prevede 16 ore di esercitazioni di laboratorio a posto singolo sulle tematiche affrontate durante il corso
Metodi didattici
Lezioni frontali ed esercitazioni di laboratorio a posto singolo
Materiale di riferimento
Richard J Reece
Analisi dei geni e dei genomi
EdiSES
T.A. Brown
Genomi 3
EdiSES
Analisi dei geni e dei genomi
EdiSES
T.A. Brown
Genomi 3
EdiSES
Moduli o unità didattiche
Modulo: Metodi biochimici
BIO/10 - BIOCHIMICA - CFU: 5
BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE - CFU: 1
BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE - CFU: 1
Esercitazioni di laboratorio a posto singolo: 16 ore
Lezioni: 40 ore
Lezioni: 40 ore
Docenti:
Ricagno Stefano, Visentin Cristina
Turni:
Docente:
Ricagno Stefano
Turno 1
Docente:
Visentin CristinaTurno 2
Docente:
Visentin Cristina
Modulo: Metodi biologico molecolari
BIO/10 - BIOCHIMICA - CFU: 1
BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE - CFU: 5
BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE - CFU: 5
Esercitazioni di laboratorio a posto singolo: 16 ore
Lezioni: 40 ore
Lezioni: 40 ore
Docenti:
Manzo Stefano Giustino, Sertic Sarah
Siti didattici
Docente/i
Ricevimento:
su appuntamento per email
dipartimento bioscienze via celoria 26, piano 5 torre b
Ricevimento:
su appuntamento chiesto via email