Single cell sequencing: a deep dive into dissecting cell populations at single cell level

Il corso offrira' una panoramica sulle tecnologie NGS a singola cellula e il flusso di lavoro a partire dalla preparazione della libraries di sequenziamento, alle modalita' di sequenziamento per finire con l'estrazione delle informazioni e l'analisi dei dati: pre processamento, alignment, normalizzazione, espressione differenziale, arricchimento funzionale. L'analisi dei dati e' costituita da sessione teoriche e pratiche nelle quali gli studenti effettueranno analisi bioinformatiche sui dati NGS. Il corso e' focalizzato sullo sviluppo di abilita' pratiche nella data analisi di dati NGS, nella capacita' di interagire in modo basico con sistemi Linux e acquisire dei fondamenti di programmazione (Python/R).