Bioinformatica e biostatistica

Bioinformatica (6 CFU):
Introduzione alla bioinformatica. Sequenziamento genomico e "next generation sequencing". Annotazione di geni e genomi. La struttura genica: introni, esoni, promotori, splicing alternativi. La struttura degli mRNA maturi eucariotici. Database biologici primari e specializzati. Browser genomici. Definizioni di similarità di sequenza, omologia, ortologia e paralogia. Allineamenti di sequenza locali e globali. Matrici di sostituzione per allineamenti di sequenze (PAM, BLOSUM). Ricerca per similarità in banche dati di sequenze (BLAST). Allineamenti multipli di sequenza. Dati di espressione. Microarray e RNA-Seq. Annotazione funzionale dei geni e gene ontology.

Biostatistica (3 CFU):
Dati (Introduzione). Statistica descrittiva. Tipi di variabili. Tabelle e rappresentazione grafica (scatterplots, istogrammi). Indici di posizione: media, mediana, moda, percentili. Varianza e deviazione standard.
Probabilità. e Probabilità condizionata. Distribuzioni di variabili aleatorie discrete e continue. Distribuzione normale. Distribuzione Ipergeometrica. Distribuzione binomiale. Distribuzione di Poisson.
Inferenza statistica (introduzione). Campioni e distribuzioni campionarie. Stima puntuale. Stima di un intervallo (intervalli di confidenza). Test di ipotesi. Inferenza sulla differenza tra medie di due campioni. Il test t di Student.