Experimental design
A.A. 2022/2023
Obiettivi formativi
Gli studenti impareranno a:
- Progettare ed eseguire esperimenti all'avanguardia utilizzando tecniche di biologia cellulare e molecolare per approcci Omici
- Discutere il potenziale tecnologico e i limiti delle tecniche utilizzate
- Spiegare che tipo di domande possono essere affrontate con gli approcci Omici
- Progettare esperimenti adeguati basati su specifiche questioni mediche o biologiche
- Eseguire trouble-shooting e sviluppare esperimenti alternativi
- Interpretare e riportare i risultati di varie tecnologie (analisi dei dati)
- Progettare ed eseguire esperimenti all'avanguardia utilizzando tecniche di biologia cellulare e molecolare per approcci Omici
- Discutere il potenziale tecnologico e i limiti delle tecniche utilizzate
- Spiegare che tipo di domande possono essere affrontate con gli approcci Omici
- Progettare esperimenti adeguati basati su specifiche questioni mediche o biologiche
- Eseguire trouble-shooting e sviluppare esperimenti alternativi
- Interpretare e riportare i risultati di varie tecnologie (analisi dei dati)
Risultati apprendimento attesi
Gli studenti acquisiranno conoscenze teoriche ed esperienza pratica nella progettazione e nell'esecuzione di esperimenti ben controllati. Le competenze chiave includeranno la capacità di progettare esperimenti, gestire il flusso di lavoro, analizzare e interpretare i dati e ideare nuove strategie per ulteriori sviluppi nella biologia molecolare e cellulare. Le attività formative forniranno competenze specifiche per l'interpretazione dei risultati.
Periodo: Primo semestre
Modalità di valutazione: Esame
Giudizio di valutazione: voto verbalizzato in trentesimi
Corso singolo
Questo insegnamento non può essere seguito come corso singolo. Puoi trovare gli insegnamenti disponibili consultando il catalogo corsi singoli.
Programma e organizzazione didattica
Edizione unica
Responsabile
Programma
· Principle of experimental design
· Basic principles of biochemical approaches
· Working with antibodies
· Immunoblot, immunoprecipitation, immunofluorescence
· Studying DNA/RNA/proteins complexes
· Mass spectrometry/metabolomics approaches and design
· Gender in experimental design
· Introduction to experimental cell model systems
· Organoid matrigel cultures
· Culture and differentiation of immortal pluripotent stem cells (iPS)
· Procedure to manipulate cells
· Cell-based assays: proliferation assays
· Cell-based assays: migration and invasion assays
· Matrigel morphogenetic assays in vitro/ex vivo
· In vivo tumorigenic and metastatic assays
· Summary of major concepts and strategies with practical examples
· HTS approaches
· Single cell approaches
· Principles of statistics
· Basic principles of biochemical approaches
· Working with antibodies
· Immunoblot, immunoprecipitation, immunofluorescence
· Studying DNA/RNA/proteins complexes
· Mass spectrometry/metabolomics approaches and design
· Gender in experimental design
· Introduction to experimental cell model systems
· Organoid matrigel cultures
· Culture and differentiation of immortal pluripotent stem cells (iPS)
· Procedure to manipulate cells
· Cell-based assays: proliferation assays
· Cell-based assays: migration and invasion assays
· Matrigel morphogenetic assays in vitro/ex vivo
· In vivo tumorigenic and metastatic assays
· Summary of major concepts and strategies with practical examples
· HTS approaches
· Single cell approaches
· Principles of statistics
Prerequisiti
Basic knowledge of chemistry and biochemistry. Notions on the nature and structure of proteins. Basic knowledge of principles of molecular biology of the cell, including mechanisms of DNA replication and regulation of gene expression.
Metodi didattici
Lectures will be accompanied by hands-on laboratory work, during which the experiments carried out in the laboratory session will reinforce the concepts presented in the lectures.
Live discussions and questions during lecture and tutorials are encouraged.
Live discussions and questions during lecture and tutorials are encouraged.
Materiale di riferimento
Slides and scientific material provided during lectures
Modalità di verifica dell’apprendimento e criteri di valutazione
Given the highly interactive nature of the course, which includes practical laboratory activities, it is essential to attend lessons regularly. Students who have followed at least 80% of the course are considered attending.
The overall assessment of the students will be based on their performance in an oral examination. The exam will consist of the discussion of 2-3 general topics, selected among those discussed during the course. Students will be also asked to comment on an experimental paper selected among those presented during the course.
The overall assessment of the students will be based on their performance in an oral examination. The exam will consist of the discussion of 2-3 general topics, selected among those discussed during the course. Students will be also asked to comment on an experimental paper selected among those presented during the course.
BIO/11 - BIOLOGIA MOLECOLARE
MED/04 - PATOLOGIA GENERALE
MED/04 - PATOLOGIA GENERALE
Esercitazioni: 16 ore
Lezioni: 40 ore
Lezioni: 40 ore
Siti didattici
Docente/i
Ricevimento:
previo appuntamento da concordare via e-mail
Ricevimento:
Previo appuntamento da concordare via e-mail
Campus IEO, Via Adamello, 16 Milano