Imaging techniques in bio-medical research
A.A. 2019/2020
Obiettivi formativi
L'analisi per immagini rappresenta un campo emergente delle scienze biomediche e ciò è dimostrato dal numero crescente di corsi disponibili presso prestigiose università nel mondo, dall'offerta di opportunità di impiego e dal sempre maggior ricorrere di queste tecnologie nelle pubblicazioni scientifiche del settore biotecnologico e biomedico. Con la frequenza del corso, lo studente impara che è possibile estendere il suo orizzonte di approccio biotecnologico mediante la raccolta di dati biologici di primaria importanza, ottenuti e rielaborati mediante l'applicazione di principi fisici e matematici di elevata precisione e riproducibilità. I dati sono poi rielaborati e processati per poter essere interpretati opportunamente.
Risultati apprendimento attesi
Alla fine del corso, lo studente sarà in grado di raccogliere e rielaborare i dati attraverso l'utilizzo di approcci biotechonologici basati sulle nuove tecniche di analisi di immagini. I risultati saranno valutati, elaborati e interpretati in modo appropriato, utilizzando principi fisici e matematici di alta precisione e riproducibilità
Periodo: Secondo semestre
Modalità di valutazione: Esame
Giudizio di valutazione: voto verbalizzato in trentesimi
Corso singolo
Questo insegnamento non può essere seguito come corso singolo. Puoi trovare gli insegnamenti disponibili consultando il catalogo corsi singoli.
Programma e organizzazione didattica
Edizione unica
Responsabile
Periodo
Secondo semestre
Prerequisiti
none
Modalità di verifica dell’apprendimento e criteri di valutazione
The exam consists of 1 final oral test (50% final mark) and 1 practical test (50% final mark)
Module: Image analysis of cells and tissue
Programma
Basic concepts in imaging. Electromagnetic radiation and interactions with Matter (2 hours),
Optics, including lenses and reflection. Generators, filters and detectors (1 hour)
Biological effects of radiation. Safety considerations (1 hour).
Imaging systems for biological molecole (Proteins, lipids, nucleic acids) (2 hours)
Trasmission microscopy (1 hour)
Scanning microscopy (1 hour)
Phase contrast microscopy (1 hour)
Fluorescence microscopy (1 hour)
Confocal and multiphoton microscopy (2 hours)
Imaging of live and fixed cells (2 hours)
Fluorescence Resonance Energy Transfer (2 hours)
Use of radioisotopes for imaging con radionuclide (1 hour)
Magnetic resonance (1 hour)
Practical training total hours
Time-lapse of living systems 2
Use of algorithms used in imaging 1
Processing, digitalization deconvolution 1
Image degradation, Spatial resolution, Signal and noise 1
Image measurements, histograms 1
Use of Image 1.62 NIH program 2
Use of Leica Confocal System 2
Use of Nikon NKM Program 2
Optics, including lenses and reflection. Generators, filters and detectors (1 hour)
Biological effects of radiation. Safety considerations (1 hour).
Imaging systems for biological molecole (Proteins, lipids, nucleic acids) (2 hours)
Trasmission microscopy (1 hour)
Scanning microscopy (1 hour)
Phase contrast microscopy (1 hour)
Fluorescence microscopy (1 hour)
Confocal and multiphoton microscopy (2 hours)
Imaging of live and fixed cells (2 hours)
Fluorescence Resonance Energy Transfer (2 hours)
Use of radioisotopes for imaging con radionuclide (1 hour)
Magnetic resonance (1 hour)
Practical training total hours
Time-lapse of living systems 2
Use of algorithms used in imaging 1
Processing, digitalization deconvolution 1
Image degradation, Spatial resolution, Signal and noise 1
Image measurements, histograms 1
Use of Image 1.62 NIH program 2
Use of Leica Confocal System 2
Use of Nikon NKM Program 2
Metodi didattici
Lectures anf practicals
Materiale di riferimento
Handouts
Module: MALDI imaging
Programma
Sample preparation 4
MALDI imaging 4
Proteins identification and analysis 4
MALDI imaging 4
Proteins identification and analysis 4
Metodi didattici
The course consists of frontal and practical lessons
Materiale di riferimento
References and Internet links will be available
Module: Molecular Imaging
Programma
Preliminary overview 4
Relaxation Theory and Mechanisms
Magnetic properties and image effects
Extracellular fluid agents 2
Organ-specific agents 2
Ultrasound theory and demonstration 3
Bioluminescent imaging and the use of reporter in vivo 2
Relaxation Theory and Mechanisms
Magnetic properties and image effects
Extracellular fluid agents 2
Organ-specific agents 2
Ultrasound theory and demonstration 3
Bioluminescent imaging and the use of reporter in vivo 2
Metodi didattici
Lectures anf practicals
Materiale di riferimento
References and Internet links will be available
Moduli o unità didattiche
Module: Image analysis of cells and tissue
VET/01 - ANATOMIA DEGLI ANIMALI DOMESTICI - CFU: 4
Lezioni: 24 ore
Docente:
Brevini Tiziana
Turni:
-
Docente:
Brevini Tiziana
Module: MALDI imaging
BIO/10 - BIOCHIMICA - CFU: 2
Lezioni: 12 ore
Docente:
Maffioli Elisa Margherita
Turni:
-
Docente:
Maffioli Elisa Margherita
Module: Molecular Imaging
VET/01 - ANATOMIA DEGLI ANIMALI DOMESTICI - CFU: 2
Lezioni: 12 ore
Docente:
Brevini Tiziana
Turni:
-
Docente:
Brevini TizianaSiti didattici
Docente/i
Ricevimento:
tutti i giorni previo appuntamento
Ricevimento:
su appuntamento via email