Miglioramento genetico avanzato

Il programma viene sviluppato in due moduli. Nel primo vengono fornite le basi di genetica quantitativa e di selezione attraverso l'approccio genomico che ha rivoluzionato il processo selettivo e sta cambiando l'approccio gestionale degli animali in produzione zootecnica. Nel secondo modulo viene sviluppata la parte relativa alla stima del valore genetico genomico degli animali e alla selezione genomica nelle popolazioni.

'H53-49-A' - 'Unita' didattica: Genetica quantitativa e selezione'.
OBIETTIVI DEL MODULO:
Il modulo ha come obiettivo fornire le conoscenze per l'interpretazione della relazione tra fenotipo e genotipo, centrale nella genetica quantitativa e nella selezione dei riproduttori. Le informazioni genomiche oggi disponibili sono una componente di base per la genetica quantitativa moderna.

ARTICOLAZIONE DEL MODULO:
Didattica frontale
1. Sequenziamento e genotipizzazione;
2. I chip di genotipizzazione per marcatori SNP;
3. Marcatori genetici e loro utilizzo nella gestione genomica delle popolazioni;
4. La variabilità genomica e fenotipica nelle specie in produzione zootecnica;
5. Strutture genetiche delle popolazioni: F1, F2, Backcross, popolazioni in Outbreeding, ibridi commerciali;
6. Quantitative Trait Loci e marcatori;
7 Parentela genomica e inbreeding genomico;
8. Il modello genetico infinitesimale in chiave genomica;
6. Concetto di Breeding Value e sua stima a partire da una o più fonti di informazione;
7. Accuratezza dell'indice e SEP. Base genetica;
8. Correlazione tra caratteri e risposta correlata;
9. Indici economici composti;
10. Gli schemi di selezione dei riproduttori;
11. Risposta alla selezione;
12. Gestione della variabilità genomica;

Esercitazioni
Le esercitazioni saranno sviluppate in aula computer su software specifici per la selezione dei riproduttori e per la gestione dei dati genomici. Gli studenti dovranno utilizzare l'ambiente R "The R software for statistical computing" (https://www.r-project.org/) (https://www.rstudio.com/).

'H53-49-B' - 'Unita' didattica: Modello misto e selezione genomica'

OBIETTIVI DEL MODULO:
Il modulo ha come obiettivo fornire le basi della valutazione genomica nelle specie in produzione zootecnica e la sua applicazione nei programmi di selezione.

ARTICOLAZIONE DEL MODULO:
Didattica frontale
1. Selezione Genomica: strumenti, popolazioni, equazioni di predizione;
2. La stima del valore di sostituzione genica nel modello a un locus;
3. La stima delle equazioni di predizione dalla "training population";
4. Applicazione delle equazioni di predizione nella "application population"
5. Il Valore Riproduttivo Genomico (GEBV);
6. Accuratezza del GEBV;
7. Il metodo "One Step";
8. Gli schemi di selezione genomici;
9. La gestione della riproduzione aziendale con le informazioni genomiche;

Esercitazioni
Le esercitazioni saranno sviluppate in aula computer su software specifici per la selezione dei riproduttori e per la gestione dei dati genomici. Gli studenti dovranno utilizzare l'ambiente R "The R software for statistical computing" (https://www.r-project.org/) (https://www.rstudio.com/).