Ree crispres - a workshop on genome editing technologies

A.A. 2021/2022
3
Crediti massimi
42
Ore totali
SSD
AGR/03 AGR/07 AGR/12 BIO/01
Lingua
Inglese
Obiettivi formativi
L'attività integrativa prevede di fornire competenze agli studenti nei seguenti ambiti:
· Identificazione dei geni target per la protezione delle piante di interesse agrario
· Pianificazione di esperimenti che utilizzino genome editing
· Analisi di sequenze derivanti da eventi di editing genomico
· Colture in vitro
· Fenotipizzazione della malattia
Durante l'emergenza pandemica, saranno condotti workshop online, basati su piattaforme di e-learning e di apprendimento attivo, inclusi laboratori virtuali e gamification.
Risultati apprendimento attesi
Il laboratorio REE fornisce disposizione 3 CFU, per un totale di 40 ore di lavoro in classe. I lavori sono svolti online, durante l'emergenza pandemica. Le lezioni sono fornite su una piattaforma di e-learning e i laboratori virtuali si basano su esperienze virtuali interattive. L'approvazione finale si basa su un progetto che lo studente prepara e presenta autonomamente alla classe e ai docenti. Il laboratorio REE fa parte di un progetto di formazione internazionale e ospita studenti di due Università europee.
Programma e organizzazione didattica

Edizione unica

Responsabile
Periodo
Secondo semestre
This course may be provided online according to the current sanitary obligations. It includes synchronous and asynchronous activities, that are delivered through MS Teams, Moodle and specific digital-laboratories.
Programma
Day 1 (9.00-17:00): Introduction and workshop on host-pathogen interaction

Day 2 (9:00-17:00): Theory and practice on in plant in vitro culture; Introduction to CRISPR

Day 3 (9:00-17:00): Theory and practice on CRISPR multiplexing

Day 4 (9:00-18:00): Workshop on cloning and rice transformation; Lecture by prof. H. Puchta

Day 5 (9:00-19:00): Theory and practice on off targets; round table and Q&A; social event

A final event organized by the University of Milano takes place in the fall.
Prerequisiti
No formal prerequisites. It is strongly advised to have a basic knowledge in molecular biology.
Metodi didattici
The course is part of an international learning experience, conducted in collaboratio with the Universities of Copenhagen and Prague and funded by the 4EU+ project. The students will work in teams with foreign mates. The course is administered remotely, using Microsoft Teams as a communication platform, and Moodle, as a didactic platform. There are lectures and interactive workshops, where the students contribute through a team-work. The workshops are conducted using immersive/interactive videos and digital laboratories.
Materiale di riferimento
Plant Genome Editing with CRISPR system, methods and protocols. (2019) Y.Qi Editor, doi: 10.1007/978-1-4939-8991-1

The CRISPres Handbook (2021). Published by the CRISPres project.
Modalità di verifica dell’apprendimento e criteri di valutazione
The knowledge acquired by the students is evaluated through a final report, based on a given .doc format, where they describe a project autonomously developed. The students have to present their project during a "knowledge challenge".
AGR/03 - ARBORICOLTURA GENERALE E COLTIVAZIONI ARBOREE - CFU: 0
AGR/07 - GENETICA AGRARIA - CFU: 0
AGR/12 - PATOLOGIA VEGETALE - CFU: 0
BIO/01 - BOTANICA GENERALE - CFU: 0
Esercitazioni: 36 ore
Lezioni: 6 ore
Docente/i
Ricevimento:
su appuntamento
via Celoria, 2 - Edificio 10
Ricevimento:
Mercoledi 10-12
DISAA - Biblioteca
Ricevimento:
Lunedì ore 10.00-12.00
Edificio 21070, primo piano