Informatica e statistica per le biotecnologie (comune)

Informatica
Il modulo di Informatica inizierà con una breve introduzione alle architetture e ai sistemi d'informazione e dielaborazione dei dati, mentre il resto del corso sarà dedicato ai principi della programmazione imperativa emodulare, utilizzando il linguaggio R come riferimento.
- Architettura di un calcolatore
- Cenni alla rappresentazione delle informazioni- Principali concetti di un generico linguaggio di programmazione
- Programmi e processi
- Ambiente R
- Variabili e assegnamenti
- Struttura dati vettore. Vettori numerici, carattere, logici
- Selezione e accesso, differenti tipologie
- Generazione di sequenze regolari
- Matrici: costruzione, concatenazione, prodotto. Selezione e accesso
- Comando table
- Gestione dati eterogenee: liste, data frame, loro tipologie di accesso
- Controllo del flusso
- Istruzioni condizionali e cicli
- Efficienza dei cicli in R
- Funzioni e Script
- Ambiente grafico di R
- Comandi plot, barplot, hist, boxplot
- Grafici a torta 2D e 3D
- Salvataggio figure
- Generazione di numeri pseudocasuali
- Principali distribuzioni di probabilità
- Funzioni qqnorm, qqline, qqplot per confrontare distribuzioni di probabilità

Statistica
Il modulo di statistica ha l'obbiettivo di fornire le nozioni fondamentali di statistica per le biotecnologie. Particolare attenzione viene data all'aspetto applicativo della statistica, con enfasi speciale rivolta all'interpretazione dei dati ed ai test usati nell'analisi dei dati biologici. Il corso prevede numerosi esempi pratici e fornisce allo studente conoscenze di base che consentano di delineare un workflow logico di supporto nella scelta dell'approccio statistico più appropriato dato il problema biologico da affrontare.

- Introduzione alla statistica. Concetti di base, popolazioni e campioni, campionamento, tipo di dati, tipo di variabili, tipo di studi
- Visualizzazione dei dati. Tabelle di frequenza, diagrammi, grafici e istogrammi
- Indici statistici e descrizione dei dati
- Stima e incertezza
- Probabilità. Evento, probabilità di un evento. Probabilità di eventi complessi
- Distribuzioni di probabilità
- Concetti di base del processo di test delle ipotesi
- Test statistici per variabili nominali. Test del chi quadrato per bontà di adattamento. Tabelle di contingenza, Odds Ratio, test del chi quadrato per indipendenza, test esatto di Fisher
- Test statistici per variabili continue e discrete

Il modulo di Informatica inizierà con una breve introduzione alle architetture e ai sistemi d'informazione e di elaborazione dei dati, per poi introdurre i principi della programmazione imperativa e modulare, utilizzando il linguaggio R come riferimento.


Programma dettagliato.

Informatica
- Cenni alla rappresentazione delle informazioni
- Principali concetti di un generico linguaggio di programmazione
- Programmi e processi
- Ambiente R.
- Variabili e assegnamenti
- Struttura dati vettore. Vettori numerici, carattere, logici
- Selezione e accesso, differenti tipologie
- Generazione di sequenze regolari
- Matrici: costruzione, concatenazione, prodotto. Selezione e accesso
- Comando table
- Gestione dati eterogenee: liste, data frame, loro tipologie di accesso
- Controllo del flusso
- Istruzioni condizionali e cicli
- Efficienza dei cicli in R
- Funzioni e Script in R
- Ambiente grafico di R
- Comandi plot, barplot, hist, boxplot
- Grafici a torta 2D e 3D
- Salvataggio figure
-Verifica di normalità
- funzioni qqnorm, qqline and qqplot

Statistica
- Introduzione alla statistica. Concetti di base, popolazioni e campioni, campionamento, tipo di dati, tipo di variabili, tipo di studi
- Visualizzazione dei dati. Tabelle di frequenza, diagrammi, grafici e istogrammi
- Indici statistici e descrizione dei dati
- Stima e incertezza
- Probabilità. Evento, probabilità di un evento. Probabilità di eventi complessi
- Distribuzioni di probabilità
- Concetti di base del processo di test delle ipotesi
- Test statistici per variabili nominali. Test del chi quadrato per bontà di adattamento. Tabelle di contingenza, Odds Ratio, test del chi quadrato per indipendenza, test esatto di Fisher
- Test statistici per variabili continue e discrete