Ree crispres - a workshop on genome editing technologies
A.A. 2023/2024
Obiettivi formativi
L'attività integrativa prevede di fornire competenze agli studenti nei seguenti ambiti:
· Identificazione dei geni target per la protezione delle piante di interesse agrario
· Pianificazione di esperimenti che utilizzino genome editing
· Analisi di sequenze derivanti da eventi di editing genomico
· Colture in vitro
· Fenotipizzazione della malattia
Durante l'emergenza pandemica, saranno condotti workshop online, basati su piattaforme di e-learning e di apprendimento attivo, inclusi laboratori virtuali e gamification.
· Identificazione dei geni target per la protezione delle piante di interesse agrario
· Pianificazione di esperimenti che utilizzino genome editing
· Analisi di sequenze derivanti da eventi di editing genomico
· Colture in vitro
· Fenotipizzazione della malattia
Durante l'emergenza pandemica, saranno condotti workshop online, basati su piattaforme di e-learning e di apprendimento attivo, inclusi laboratori virtuali e gamification.
Risultati apprendimento attesi
Il laboratorio REE fornisce disposizione 3 CFU, per un totale di 40 ore di lavoro in classe. I lavori sono svolti online, durante l'emergenza pandemica. Le lezioni sono fornite su una piattaforma di e-learning e i laboratori virtuali si basano su esperienze virtuali interattive. L'approvazione finale si basa su un progetto che lo studente prepara e presenta autonomamente alla classe e ai docenti. Il laboratorio REE fa parte di un progetto di formazione internazionale e ospita studenti di due Università europee.
Periodo: Secondo semestre
Modalità di valutazione: Giudizio di approvazione
Giudizio di valutazione: superato/non superato
Corso singolo
Questo insegnamento può essere seguito come corso singolo.
Programma e organizzazione didattica
Edizione unica
Responsabile
Periodo
Secondo semestre
Programma
Day 1: Introduction and bioinformatics lab
Day 2: Gateway cloning; E. coli transformation; miniprep; inoculation
Day 3: Rice transformation and visit of mutants growing in the parcels
Day 4: Workshop sequence analysis
Day 5: Invited speaker; round table and Q&A.
A final event takes place in the fall.
Day 2: Gateway cloning; E. coli transformation; miniprep; inoculation
Day 3: Rice transformation and visit of mutants growing in the parcels
Day 4: Workshop sequence analysis
Day 5: Invited speaker; round table and Q&A.
A final event takes place in the fall.
Prerequisiti
No formal prerequisites. It is strongly advised to have a basic knowledge in molecular biology.
Good understanding of English is required.
Good understanding of English is required.
Metodi didattici
The workshop includes lectures and practical experiences. The practical experiences will take place in the wet lab and at the computer.
Materiale di riferimento
Plant Genome Editing with CRISPR system, methods and protocols. (2019) Y.Qi Editor, doi: 10.1007/978-1-4939-8991-1
The CRISPres Handbook (2021). Published by the CRISPres project.
The CRISPres Handbook (2021). Published by the CRISPres project.
Modalità di verifica dell’apprendimento e criteri di valutazione
The knowledge acquired by the students is evaluated through a final report, based on a given .doc format, where they describe a project autonomously developed. If a minimum set of competencies will not be reached, the student will not have the 3 ECTS granted. The competencies will be evaluated during the final discussion. The students have to present their project during a "knowledge challenge": teams of students prepare a project on a topic of choice and using the tools learned during the class. All the teams present their project and the teachers + peers will select the best one, based on explicit criteria.
Students with SLD may request for specifically adapted evaluation modalities.
Students with SLD may request for specifically adapted evaluation modalities.
AGR/03 - ARBORICOLTURA GENERALE E COLTIVAZIONI ARBOREE
AGR/07 - GENETICA AGRARIA
AGR/12 - PATOLOGIA VEGETALE
BIO/01 - BOTANICA GENERALE
AGR/07 - GENETICA AGRARIA
AGR/12 - PATOLOGIA VEGETALE
BIO/01 - BOTANICA GENERALE
Esercitazioni in aula informatica: 16 ore
Laboratori: 16 ore
Lezioni: 8 ore
Laboratori: 16 ore
Lezioni: 8 ore
Docente/i
Ricevimento:
su appuntamento
Ricevimento:
Mercoledi 10-12
DISAA - Biblioteca