Pipelines and tools for omics data analyses

Il corso offrira' una panoramica sulle tecnologie NGS per trascrittomica (cellula singola e bulk) e il flusso di lavoro a partire dalla preparazione della libraries di sequenziamento, alle modalita' di sequenziamento per finire con l'estrazione delle informazioni e l'analisi dei dati: pre processamento, alignment, normalizzazione, espressione differenziale, arricchimento funzionale. L'analisi dei dati e' costituita da sessione teoriche e pratiche nelle quali gli studenti effettueranno analisi bioinformatiche sui dati NGS. Il corso e' focalizzato sullo sviluppo di abilita' pratiche nella data analisi di dati NGS, nella capacita' di interagire in modo basico con piattaforma di analisi acquisire open source, come RStudio. Il corso si svolgerà in due giornate, presso IFOM o LITA (TBD).